若交換后的溶液已達到預定要求，或離子交換樹脂已呈“飽和狀態”，就從生產線上切斷柱交換，在同一柱中或其他柱內用解吸液解吸，離子交換樹脂再生后用于下次交換。采用離子交換柱，相當于將柱內離子交換樹脂分多批次與溶液進行交換反應，交換后的溶液及時和離子交換樹脂分離。流過離子交換樹脂床的溶液成分隨時間和床高度變化。

    陽離子交換柱是在高純度的惰性硅膠表面鍵合一種新型的聚合磺酸基陽離子交換配位體。這種*的鍵合結構是一種穩定的聚合包膜結構，比普通的聚合物離子交換柱柱效更高，且具有更好的機械強度和重現性。離子交換柱技術在水處理領域中有廣泛的應用。如水質軟化、除鹽、高純水制取、工業污水處理、重金屬及貴重金屬回收等。

    離子交換層析中，基質是由帶有電荷的樹脂或纖維素組成。帶有正電荷的稱之陰離子交換樹脂；而帶有負電荷的稱之陽離子樹脂。離子交換層析同樣可以用于蛋白質的分離純化。由于蛋白質也有等電點，當蛋白質處于不同的pH條件下，其帶電狀況也不同。陰離子交換基質結合帶有負電荷的蛋白質，所以這類蛋白質被留在柱子上，然后通過提高洗脫液中的鹽濃度等措施，將吸附在柱子上的蛋白質洗脫下來。結合較弱的蛋白質首先被洗脫下來。反之陽離子交換基質結合帶有正電荷的蛋白質，結合的蛋白可以通過逐步增加洗脫液中的鹽濃度或是提高洗脫液的pH值洗脫下來。